Фамилия Зекрин — одна из тех, где сходу не угадаешь ни корень, ни происхождение. На первый взгляд она напоминает тюркские фамилии на -ин, образованные от личных имён или прозвищ. И это верное направление.

Основа «Зекр» восходит к арабскому слову «зикр» (ذكر) — поминание, восхваление Аллаха, религиозная практика в исламе. В тюркской среде, особенно у татар и башкир, слово «зекер» или «зикер» могло стать прозвищем человека набожного, постоянно творящего зикр, либо именем, данным по религиозной традиции. Отсюда и фамилия Зекрин — буквально «сын (потомок) того, кого звали Зекр» или «относящийся к Зекру».

Суффикс -ин в данном случае — не русский притяжательный, а скорее адаптированный тюркский формант, указывающий на принадлежность к роду. В русской канцелярской традиции такие фамилии оформляли по модели «Зекр + -ин», то есть «чей? — Зекрин». Аналогичным образом образованы фамилии Гатин (от «гат» — тайна), Сафин (от «саф» — чистый) и многие другие.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с диалектным русским словом «зекра» — в некоторых говорах так называли закром, сусек или лавку в амбаре. Тогда Зекрин — прозвище человека, живущего у закромов или торгующего зерном. Однако эта гипотеза слабее: во-первых, фамилия почти не встречается в центральных русских областях, во-вторых, слово «зекра» — редкое и локальное, тогда как арабский корень широко распространён в Поволжье и на Урале.

Фамилия Зекрин типична для татарской и башкирской ономастики. Встречается она нечасто, но устойчиво фиксируется в Татарстане, Башкортостане, а также среди мишарей и казанских татар. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках носители фамилии — в основном крестьяне и мещане, что характерно для массового закрепления фамилий в XIX веке.

Таким образом, Зекрин — фамилия с прозрачной религиозной подоплёкой, указывающая на предка, чьё имя или прозвище было связано с исламской практикой поминания.