Фамилия Зелюнка звучит нарочито по-домашнему, почти ласкательно, и это её главная загадка. В ней нет типичного русского суффикса принадлежности (-ов, -ин), нет польского или украинского -ский. Перед нами — прозвище, которое застыло в форме уменьшительного имени или существительного. Основа здесь — «зелён-», и сразу напрашивается связь с цветом. Но не торопитесь записывать предка в крестьянина, любившего зелёную одежду.

Самая правдоподобная версия выводит фамилию из диалектного или профессионального прозвища «Зелюнка». В южнорусских и белорусских говорах «зелюнка» — это не просто что-то зелёное, а конкретно молодая, ещё зелёная трава, озимь, а иногда и незрелый плод. Прозвище могли дать человеку с «зелёным», то есть молодым, неопытным характером, либо тому, кто работал с зеленью — огороднику, травнику, знахарю, собиравшему «зелье» (травы). Слово «зелье» в древнерусском означало и траву, и яд, и лекарство, так что прозвище могло приобрести и оттенок «колдун», «знахарь».

Суффикс -к(а) в фамилиях — штука редкая и показательная. В русской традиции фамилии на -ка встречаются в основном на западе и юге (например, Стецька, Бондарка), и часто они фиксировали прозвище в его исходной, неизменённой форме, а не отчество. Это значит, что фамилия Зелюнка могла закрепиться в среде, где патронимы ещё не вытеснили прозвищный уклад — скорее всего, среди крестьян или казачества. Форма на -а не склоняется по мужскому роду как типичная русская фамилия, что выдает её украинское или белорусское происхождение: на этих землях фамилии вроде Зелюнка, Голубка, Соловейка — обычное дело.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с польским словом «zielonka» (зелёнка, зелёная краска, зелёная лягушка). В этом случае фамилия могла возникнуть на землях бывшей Речи Посполитой и обозначать либо красильщика, либо человека с зеленоватым оттенком кожи или глаз. Однако ударение в польском варианте падало бы на второй слог (Зелю́нка), тогда как в русском произношении чаще слышится Зелю́нка или Зелюнка́ — первое указывает на украинскую огласовку с мягким «л».

Итог прост: фамилия Зелюнка — редкий южнорусский или украинский отапеллятив (прозвище от нарицательного слова), которое прямо говорит о занятии или свойстве первого носителя. Никакой аристократии, никаких знатных родов — только зелень, трава и, возможно, деревенский знахарский опыт. Потомкам стоит искать корни предков в Черниговской, Полтавской или Курской губерниях, где такие прозвища были в ходу.