Фамилия Зенякина — это женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Зенякин. Её происхождение чаще всего связывают с именем или прозвищем Зеняка. В первом случае Зеняка — это уменьшительная форма от крестильных имён Зенон (с греческого — «божественный») и Зиновий («божья жизнь, богоугодно живущий»). Такие сокращённые имена в быту были обычны для простых сословий: полное имя использовали в церкви, а в семье и общине человека звали Зеня, Зеняка. Соответственно, фамилия Зенякин буквально означает «сын Зеняки» или «потомок Зеняки».

Есть и вторая версия, которая выводит прозвище Зеняка из славянского корня «зень». У этого корня два значения. Первое — «глаз», откуда устаревшее слово «зеница» (зрачок). В этом случае прозвище могли дать человеку с острым зрением, зоркому. Второе значение — «пол, низ»: так могли прозвать того, кто жил в низине или в нижней части села. Какая из версий вернее — сказать трудно, но обе показывают, что фамилия родилась из прозвища, а не из благородного титула.

Важно, что суффикс -ин указывает на принадлежность: в русской традиции фамилии на -ин образовывали от основ, оканчивающихся на -а или -я. Зеняка дал Зенякина — так же, как Кузьма даёт Кузьмин. Эта модель распространена в северных и центральных областях России. Географически фамилия Зенякина встречается нечасто, но её корни — в народной среде, где имена сокращали, а прозвища цеплялись за внешность или место жительства.