Фамилия Зенютина — женская форма мужской фамилии Зенютин, которая образовалась от имени или прозвища Зенюта. В основе лежит разговорная форма церковного имени Зиновий (в переводе с греческого — «живущий по-божески»). На русской почве это имя нередко сокращали до Зеня, а затем добавляли уменьшительный суффикс -ют- (по аналогии с Мишутка, Ванюта). Так появилось прозвище Зенюта — ласковое обращение к человеку по имени Зиновий, а от него — фамилия Зенютин.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Зенютин буквально значит «сын Зенюты». Такая модель типична для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ин широко распространены. В южных областях и на Украине чаще встречается форма Зенютенко, а в Беларуси — Зенюта (без суффикса).

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «зенюха» — так в некоторых говорах называли лентяя или нерасторопного человека. Но она не подтверждается словарями и выглядит натянутой, поэтому основным остаётся происхождение от имени Зиновий.

Фамилия Зенютина редкая. По переписям XVIII–XIX веков её носители встречались в основном среди крестьян Вологодской и Костромской губерний. Это говорит о том, что предки Зенютиных были, скорее всего, земледельцами из северной России. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

В современном написании фамилия сохраняет ударение на второй слог: Зеню́тина. Ошибки вроде «Зинютина» или «Зенютина» с буквой «ё» встречаются, но исторически верна форма через «е».