Фамилия Зезера — одна из тех редких русских фамилий, чья форма сразу вызывает вопросы. В ней нет привычных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -а в мужском варианте (Зезера, а не Зезеров) выдает в ней прозвищное происхождение, застывшее в именительном падеже. Такие фамилии характерны для украинской, белорусской и южнорусской традиции, где прозвище часто переходило в фамилию без дополнительного оформления.

Корень фамилии — «зезер» — не имеет однозначного толкования в современном русском языке. Наиболее вероятная версия связывает его с диалектным словом «зезюля» или «зозуля» — так в южных и западных говорах называют кукушку. В украинском и белорусском языках «зозуля» — общеупотребительное название этой птицы. Фонетически «Зезера» могла возникнуть из «Зозуля» через аканье (переход о в е) или как вариант произношения в конкретном говоре. Тогда прозвище Зезера давали либо человеку с характерным голосом, напоминающим кукование, либо тому, кто, по народным поверьям, был связан с этой птицей — например, одинокому или вечно спешащему человеку.

Менее распространенная, но допустимая версия — связь с глаголом «зевать» или «зиять». В этом случае прозвище Зезера могло означать «ротозей», «зевака» или, напротив, человека с широко раскрытыми глазами. Однако эта гипотеза слабее: для такого значения в русских говорах есть более типичные формы вроде «Зевака» или «Зёва». Птичья версия выглядит убедительнее, тем более что фамилии от названий птиц (Соколов, Воробьев, Кукушкин, Зозуля) — один из самых распространенных пластов русской антропонимии.

Географически фамилия Зезера встречается крайне редко. Единичные носители зафиксированы на юге России и в восточных областях Украины. В дореволюционных переписях она не была массовой, что подтверждает ее прозвищное, а не патронимическое происхождение: скорее всего, фамилия закрепилась за одним родом и не получила широкого распространения.

Словообразовательная модель фамилии проста: основа «зезер-» плюс окончание -а, типичное для существительных женского рода. В мужском варианте фамилия не склоняется по падежам как типичное русское слово — она остается неизменной (Иван Зезера, Петра Зезеры). Это еще один признак ее южнорусского или украинского корня, где такие формы в фамилиях обычны.

Таким образом, фамилия Зезера с большой вероятностью восходит к диалектному названию кукушки. Предок-носитель получил прозвище за голос, поведение или внешнее сходство с этой птицей, а фамилия закрепилась в той форме, в какой прозвище бытовало в речи.