Фамилия Згоникова — женская форма фамилии Згоников, и её разбор стоит начать с суффикса. Формант -ов- указывает на типичную русскую патронимическую модель: фамилию дали по отцу, которого в быту называли Згоник. Суффикс -ик в основе встречается реже, чем -ник, и это сразу сужает круг возможных значений.

Самая вероятная версия — связь с глаголом «сгонять» или «згонять» (в диалектах — «згонить»). В русских говорах «згоник» могли называть человека, который сгоняет скот, перегоняет стадо с места на место, то есть пастуха или погонщика. В северных и сибирских говорах слово «згон» означало также место сбора скота, и прозвище могло закрепиться за тем, кто отвечал за этот участок работы. Ремесло было распространённым, а фамилия — редкой, что говорит о локальном, возможно, деревенском происхождении.

Менее убедительна, но возможна версия от слова «зга» — в древнерусском «дорога, путь» (ср. «ни зги не видно»). Тогда Згоник — тот, кто прокладывает путь, проводник. Однако эта гипотеза слабее: суффикс -ик чаще образует названия лиц по действию, а не по предмету, и примеров с таким значением в ономастике почти нет.

Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах и не фиксируется в крупных исторических переписях центральной России. Это указывает на крестьянское или мещанское сословие, скорее всего, из регионов, где были развиты скотоводство и отгонное животноводство — например, южные губернии или Заволжье. В современной России фамилия остаётся редкой, с очагами бытования в Нижегородской и Кировской областях.