Фамилия Жабинцев — это типичный пример «топонимической» фамилии, то есть такой, которую давали человеку по названию места, откуда он был родом. В основе лежит название населённого пункта Жабино. Таких сёл и деревень в России несколько: одно в Гатчинском районе Ленинградской области, другое — в Чаплыгинском районе Липецкой области, третье — в Усвятском районе Псковской области. Предок, носивший прозвище Жабинец, был выходцем из одного из этих мест. Со временем прозвище закрепилось как фамилия, и потомки стали Жабинцевыми.

Суффикс -ев- в окончании фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Жабинцев, то есть сын или потомок Жабинца. Такая модель образования (название села + суффикс -ец + фамильный суффикс -ев) характерна для южнорусских и западнорусских земель, где часто называли человека по месту жительства, а не по имени или ремеслу.

Менее вероятная, но тоже возможная версия связывает фамилию с нецерковным именем или прозвищем Жаба. В старину такие «животные» прозвища давали не в обиду, а по языческим традициям — чтобы обмануть злых духов или подчеркнуть какую-то черту характера. Однако в случае с Жабинцевым эта версия слабее: если бы основа была личным прозвищем, фамилия скорее звучала бы как Жабин (по модели Иванов, Петров, Зайцев). Суффикс -ец- как раз и выдает «географическое» происхождение: он означает «житель того-то места».

О точном времени возникновения фамилии говорить сложно — процесс становления фамилий на Руси растянулся на несколько столетий. Но сама форма Жабинцев — довольно поздняя, она могла окончательно закрепиться в XVII–XVIII веках, когда крестьянам и служилым людям начали массово присваивать фамилии по месту приписки.