Фамилия Жаксыбай образована от казахского имени Жаксыбай, которое состоит из двух компонентов: «жаксы» и «бай». В переводе с казахского языка «жаксы» означает «хороший, добрый человек», а слово «бай» в переводе с тюркского и казахского языков имеет значение «богатый (настоящий) человек». В прошлом термин «бай» использовался как титул богатых, властвующих людей. Возможно, давая своему сыну имя Жаксыбай, родители надеялись, что он станет добрым, богатым, уважаемым человеком. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, фамилия Жаксыбай восходит к названию киргизской реки Джаксы-бай, которая «берет начало в горном кряже Акчате, течет на юго-запад, прорезает озеро Сасык-куль и, не дойдя до реки Урала, теряется в песках». Возможно, основатель рода Жаксыбай был родом из этих мест. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.