Фамилия Жакубекова — яркий пример того, как тюркское имя, пройдя через русскую канцелярскую традицию, превратилось в фамилию, привычную для казахской, киргизской и каракалпакской среды. В основе лежит мужское личное имя Жакубек, которое, в свою очередь, является сложносоставным и несёт в себе два отчётливых смысловых пласта.

Первая часть — Жакуб — это тюркская и арабо-персидская адаптация библейского имени Иаков (Якуб). В исламской традиции пророк Якуб почитается как один из праотцов, и имя это широко распространено среди мусульманских народов. Вторая часть — бек — древний тюркский титул, означающий «господин», «князь», «правитель». В именах этот компонент служил не столько указанием на реальный социальный статус, сколько пожеланием благородства, силы и уважения. Таким образом, имя Жакубек переводится как «господин Якуб» или «князь Якуб» — форма, подчёркивающая почтение к носителю имени.

Фамилия образована по русской словообразовательной модели: к основе Жакубек добавлен патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Жакубеков), а затем — типичное женское окончание -а. Изначально Жакубековы — это потомки человека по имени Жакубек. Важно, что фамилия не имеет отношения к славянским корням или географическим названиям: она целиком восходит к личному имени, что характерно для многих фамилий, возникших в XIX–XX веках у народов Средней Азии и Казахстана при фиксации в российских метрических книгах.

В отличие от более распространённых вариантов вроде Жакупов (от простого Жакуп) или Жакубаев, форма Жакубекова сохранила архаичный титульный компонент. Это указывает на то, что предок носительницы фамилии, вероятно, был человеком заметным в своей общине — либо по рождению, либо по заслугам, раз имя ему дали с таким «княжеским» добавлением. Встречается фамилия преимущественно в южных регионах Казахстана и в Киргизии, где традиция сложных имён с компонентом «бек» особенно сильна.