Фамилия Жакубеков — редкий пример, где арабское имя прошло через тюркскую языковую среду, а затем получило русский фамильный суффикс. Основа здесь — мужское имя Жакуб, тюркский вариант библейского и коранического Якуба (Иакова). В исламской традиции Якуб — пророк, поэтому имя широко распространено у народов, исповедующих ислам.

Модель образования прозрачна: к основе Жакуб добавили тюркский компонент -бек («господин», «князь», «предводитель»), характерный для составных имён в казахской, киргизской, узбекской среде. Получилось имя Жакубек — «господин Якуб» или «князь Якуб». Такая конструкция (имя + титул) типична для кочевой аристократии: она подчёркивала не только религиозную принадлежность, но и социальный статус. Фамильный суффикс -ов русифицировал эту форму, закрепив её в документах Российской империи и СССР.

Географически фамилия тяготеет к Казахстану и прилегающим регионам Средней Азии. В России встречается редко, в основном у потомков переселенцев XX века. Сословной принадлежности предков по фамилии точно не определить: -бек в составе имени мог быть и реальным титулом, и просто данью традиции. Однако само наличие этого элемента говорит о том, что предок носителя фамилии не был рабом или безродным — имя давали с расчётом на уважение.

Интересная деталь: в документах XIX — начала XX века фамилию могли записывать через «ю» — Жакюбеков, что точнее передавало казахское произношение. Но в советских паспортах закрепился вариант через «у», как более привычный для русского уха. Сегодня обе формы встречаются, но «Жакубеков» — основной.