Фамилия Жакыпбеков образована от мужского тюркского имени Жакыпбек. Первая из них ведет свое начало от имени Жакып, которое представляет собой казахский вариант арабского имени Якуб – «сопутствующий, сопровождающий, не отстающий, идущий следом». Вторая часть восходит к древнетюркскому «бек» - «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Таким образом, потомок человека, которого звали Жакыпбек, со временем получил фамилию Жакыпбеков.