Фамилия Жакыпов образована от имени Жакып. Оно представляет собой казахский вариант арабского имени Якуп, которое означает «сопутствующий, сопровождающий, не отстающий, идущий следом». Имя Якуп принадлежало одному из пророков, младшему из сыновей-близнецов патриарха Исаака и Ревекки, родившемуся после двадцатилетнего бесплодного брака. Таким образом, потомок человека, которого звали Жакып, со временем получил фамилию Жакыпов.