Фамилия Жакыпбекова — женская форма фамилии Жакыпбеков. Она образована от мужского тюркского имени Жакыпбек, и её разбор даёт ключ к пониманию социального статуса и религиозных корней предков. Фамилия напрямую указывает на потомка человека по имени Жакыпбек.

Имя распадается на два смысловых блока. Первая часть, Жакып, — это казахский вариант арабского имени Якуб (библейский Иаков). В арабском языке корень означает «сопутствующий», «идущий следом», «не отстающий». В мусульманской традиции пророк Якуб почитается как один из праведников, поэтому имя широко распространено среди тюркских народов, принявших ислам.

Вторая часть — древнетюркский титул «бек» (также «бий», «бик»). В степной иерархии бек означал «князь», «повелитель», «господин», «глава рода». В составных именах этот компонент указывал на знатное происхождение или высокое положение: так родители могли подчеркнуть, что видят сына будущим лидером. Таким образом, имя Жакыпбек переводится как «князь Якуб» или «господин, идущий следом» — сочетание религиозного имени с социальным титулом.

Фамилия закрепилась по типичной для славянского делопроизводства модели: к тюркской основе добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском варианте -ова). В Российской империи при переписях и учёте кочевого населения казахские имена часто русифицировали именно таким способом, что и дало фамилию Жакыпбеков.

С точки зрения происхождения, родоначальник Жакыпбеков жил, скорее всего, на территории современного Казахстана или в приграничных областях Средней Азии. Судя по составу имени, он мог быть из среды степной аристократии или уважаемого рода, где ценили как исламскую учёность, так и военно-административную власть. Со временем потомки расселились, и сегодня носители фамилии встречаются не только в Казахстане, но и в Киргизии, а также среди казахской диаспоры в России.