Фамилия Жантлисов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не оставляет сомнений в своей географии и происхождении. В отличие от большинства русских фамилий на -ов, образованных от имён или названий профессий, эта отсылает к тюркскому миру, а точнее — к казахской или башкирской языковой среде.

Ключ к разгадке — корень «жантлис». Это искажённое тюркское «жантык» или «янтык» (варианты: жантық, янтық), что означает «кривой», «наклонный», «покосившийся». В казахском языке слово «жантық» употребляется и в прямом смысле (кривое дерево, покосившийся дом), и как прозвище для человека с хромотой или искривлённой осанкой. Суффикс -ов в конце — чисто русский, патронимический: так фамилию адаптировали при записи в документах, например, при переписи или призыве на военную службу. То есть Жантлисов — это «сын того, кого прозвали Кривым».

Версия о том, что основа восходит к личному имени, маловероятна. В тюркской ономастике имя Жантлис (или Янтык) не зафиксировано как распространённое — это именно прозвищная характеристика. Интересно, что в русских говорах Оренбуржья и Поволжья, где веками жили татары и башкиры, фамилия могла писаться и как Янтыков, и как Ентыков. Форма Жантлисов — скорее всего, результат «окающего» произношения или ошибки писаря, который записал прозвище на слух, заменив тюркское «к» на русское «с» (через «лис» вместо «лык»).

Носители фамилии Жантлисов — это потомки тюркского населения, перешедшие в русское сословие (чаще всего государственные крестьяне или казаки) в XVIII–XIX веках. Географически фамилия тяготеет к южному Уралу и Западной Сибири: единичные записи встречаются в метрических книгах Оренбургской губернии и в архивах Челябинской области. Дворянского происхождения у неё нет — это крестьянско-казачья фамилия, образованная от бытового прозвища, которое давали по заметной внешней примете.