Фамилия Жанцанов — одна из тех, что сразу выдают регион происхождения. Её основа, суффикс и даже звучание указывают на бурятские или монгольские корни. Образована она по русской модели патронимических фамилий: к основе Жанцан прибавили типичный русский суффикс -ов, означающий «чей?», «сын кого?». Такую схему массово применяли в XIX веке, когда бурятам и другим народам Восточной Сибири давали фамилии для официального учёта.

В основе лежит имя Жанцан. Оно восходит к тибетскому слову «джанцан» (rgyal mtshan), что переводится как «знамя победы» или «стяг». В буддийской традиции это один из восьми благоприятных символов, а в личных именах оно несло пожелание славы, воинской удачи или духовной высоты. Имя Жанцан (в разных транскрипциях — Жамцан, Жанцан) было распространено у бурят, калмыков и тувинцев, особенно среди лам и родов, связанных с буддийскими монастырями.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в одном ряду с такими, как Жамбалов, Доржиев, Цыренов. Все они — русифицированные варианты тибетско-монгольских имён. Суффикс -ов здесь не исконно славянский по происхождению, а наложен сверху, как стандартная форма для приведения фамилий к общероссийским нормам. Внутри бурятской среды фамилия могла бы звучать как Жанцановых или Жанцанов, но в официальных документах закрепился именно мужской родительный падеж с -ов.

Носители фамилии Жанцанов — это почти наверняка потомки бурят, живших в Забайкалье или Иркутской области. Судя по основе, предок мог быть человеком, связанным с религией или военным делом, либо просто получить имя в честь буддийского символа. Встречаемость фамилии невысокая, она редка даже среди бурятских фамилий, что говорит о её локальном характере — возможно, она закрепилась в одном-двух родах.

Есть и другая, менее вероятная версия: что Жанцанов — это вариант фамилии Жанцов или Жанцев, образованной от русского прозвища Жанец (от «жан» — старое диалектное слово, означающее «зной» или «жара»). Но против этого говорит ясная тибетская этимология имени и устойчивая региональная привязка. Спор здесь решается просто: если фамилия встречается в Восточной Сибири, у бурят, то корень однозначно не славянский.