Фамилия Жаркаускас восходит к славянскому корню «жар». Прозвище Жаркау мог получить человек с ярко-рыжими волосами. Кроме того, оно могло указывать на определенные черты характера предка-родоначальника данной фамилии, такие как вспыльчивость и несдержанность в проявлении эмоций. Суффикс -скас относится к распространенным литовским фамильным суффиксам.