Фамилия Жекулина — женская форма от Жекулин, а та, в свою очередь, образована от мужского прозвища или нецерковного имени Жекуля. Основа здесь — корень «жек-», который в русских говорах имеет несколько значений. В северных и центральных диалектах «жек» или «жёк» — это звукоподражание удару, резкому движению, отсюда же глагол «жекать» (бить, сечь). Человек мог получить прозвище Жекуля за резкость, драчливость или за манеру говорить отрывисто, «жекать». Впрочем, есть и более прозаичная версия: в некоторых регионах «жекулей» называли того, кто постоянно жуёт, то есть медлительного или жадного до еды человека.

Суффикс «-уля» в русских фамилиях встречается реже, чем «-ка» или «-ша», и придаёт основе уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный оттенок. Такие формы часто закреплялись за детьми или младшими членами семьи: Жекуля могло быть не столько прозвищем взрослого, сколько домашним именем мальчика, которое потом перешло в фамилию.

Географически фамилия Жекулин (и Жекулина) тяготеет к северо-востоку России. Встречается она в основном в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, а также в Пермском крае — то есть на территории бывшего Новгородского Севера и Вятской земли. Это наводит на мысль, что прозвище возникло именно в новгородских говорах, где «жекнуть» означало «стукнуть», «ударить». В южных и западных регионах России фамилия практически не фиксируется.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить значение. Есть фамилия Жеков (от «жек» — удар), есть Жекалов (от «жекать» — кричать, звать), а вот Жекулин стоит особняком именно из-за суффикса. Если Жеков могло быть прозвищем силача или забияки, то Жекулин — скорее ласковое или ироничное прозвище того же человека, но в кругу семьи. То есть предок носительницы фамилии, вероятно, был человеком с крутым нравом или резким голосом, но в быту его называли уменьшительно — Жекуля.

Ударение в фамилии — на второй слог: Жеку́лина. Встречающийся изредка вариант с ударением на первый (Же́кулина) считается ошибочным, хотя в некоторых местных говорах возможно смещение. В официальных документах XIX — начала XX века фамилия записывалась как Жекулинъ, с твёрдым знаком на конце, что типично для мужской формы до реформы орфографии 1918 года.