Фамилия Жендубаева образована от имени Жендубай, которое состоит из двух компонентов: «жен» и «дубай». Первая часть имени восходит к слову «жан», «джан», которое в переводе с персидского означает «душа». Компонент «дубай» в переводе с киргизского имеет два значения: «двойной» и «молитвословие с пожеланиями благополучия». Можно предположить, что имя Жендубай получил один из братьев-близнецов. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Жендубаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.