Фамилия Жендубаев образована от имени Жендубай, которое состоит из двух компонентов: «жен» и «дубай». Первая часть имени восходит к слову «жан», «джан», которое в переводе с персидского языка означает «душа». Компонент «дубай» в переводе с киргизского языка имеет два значения: «двойной» и «молитвословие с пожеланиями благополучия». Исходя из этого, можно предположить, что имя Жендубай получил один из братьев-близнецов. Кроме того, не исключено, что родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну стать достойным мусульманином.