Фамилия Жендубаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Жендубаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Жендубаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Жендубаев образована от имени Жендубай, которое состоит из двух компонентов: «жен» и «дубай». Первая часть имени восходит к слову «жан», «джан», которое в переводе с персидского языка означает «душа». Компонент «дубай» в переводе с киргизского языка имеет два значения: «двойной» и «молитвословие с пожеланиями благополучия». Исходя из этого, можно предположить, что имя Жендубай получил один из братьев-близнецов. Кроме того, не исключено, что родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну стать достойным мусульманином. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Жендубаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Жендубаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.