Фамилия Жэрдан — редкий случай, когда написание сразу выдаёт нерусское происхождение. В исконно русских фамилиях сочетание «жэ» почти не встречается: после шипящих под ударением традиционно пишется «жё» (Жёлудев, Жёрнов). Буква «э» после «ж» — примета заимствований или фамилий, записанных на слух в западных губерниях Российской империи. Скорее всего, перед нами белорусский или польский вариант фамилии Жердан (Жардан, Жэрдон).

Основа «жэрд-» восходит к польскому żerdź или белорусскому жэрдка — «жердь», «шест». В славянских языках так называли длинную тонкую палку, которой подпирали крышу, вешали рыбу для вяления или отмеряли землю. Фамилия могла возникнуть как прозвище высокого, худого человека — «жердь», «длинный как шест». В польской ономастике известна фамилия Żerdziński, а Żerdan — её возможный усечённый вариант.

Вероятно и другое объяснение: в польских говорах żerdź означало не только жердь, но и перекладину в ткацком станке. Тогда прозвище Жэрдан мог получить ткач или плотник, делавший такие станки. Суффикс -ан в польских и белорусских фамилиях часто указывает на носителя признака: Жэрдан — «тот, кто связан с жердью» (по росту или ремеслу).

Фамилия не фиксируется в дворянских родословных книгах и не дала известных исторических деятелей. Её география, скорее всего, ограничена западными регионами бывшей Речи Посполитой — Гродненщиной, Брестчиной, Подляшьем. Встречаются варианты Жердан, Жардан, а в белорусском произношении — Жэрдан (с твёрдым [р]).

Таким образом, носитель фамилии Жэрдан может с высокой вероятностью считать своими предками крестьян или ремесленников из западнорусских земель, получивших прозвище по росту или профессии, связанной с жердями.