Фамилия Жардан — редкий случай, где сталкиваются две совершенно разные версии происхождения. Первая и самая очевидная ведет к французскому слову «jardin» — «сад». Если принять эту версию, то прозвище Жардан мог получить либо садовник по роду занятий, либо человек, живший в живописной местности, известной своими садами. Такое объяснение кажется логичным, но есть нюанс: для русской ономастики французская основа в фамилии — явление не массовое, а скорее единичное, что делает эту версию возможной, но не бесспорной.

Вторая версия уводит нас в библейскую древность. Согласно ей, фамилия Жардан — это фонетически измененное название реки Иордан (Jordan). С семитских языков название переводится как «канава, сток» или «струиться, нисходить». Иордан — священная река для всех христиан, многократно упомянутая в Ветхом Завете как место чудесных событий, например, перехода израильтян посуху под руководством Иисуса Навина. В этом случае прозвище могли дать глубоко верующему человеку или уроженцу берегов Иордана. Эта версия выглядит весомее: переход «Иордан» → «Жардан» типичен для народной этимологии, когда сложное иностранное слово упрощается на слух. К тому же, в русских говорах фамилии, образованные от названий библейских рек и мест, встречаются чаще, чем «французские» прозвища садовников.

С точки зрения словообразования, фамилия не имеет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что указывает на ее позднее закрепление или нерусское происхождение. Скорее всего, она могла возникнуть в среде, где было сильно влияние церковной культуры, — среди духовенства или крестьян, получивших прозвище по религиозному символу.