Фамилия Жерегя — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её форма не вписывается в стандартные русские модели на -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: корни фамилии, скорее всего, нерусские, а её носители — выходцы из регионов, где действовали иные словообразовательные традиции.

Скорее всего, фамилия образована от прозвища или имени, которое в основе имеет тюркское или кавказское слово. Наиболее вероятная версия — связь с тюркским «жере» (или «жер») — «земля». В таком случае Жерегя могло быть прозвищем человека, связанного с землёй: крестьянина, землемера или того, кто получил имя по месту рождения. Суффикс -гя в тюркских языках часто образует уменьшительно-ласкательные или принадлежные формы, поэтому прозвище могло означать «землячок», «земной» или «принадлежащий земле». Вторая версия, менее распространённая, — происхождение от кавказского «жерег» (в некоторых языках — «волк» или «зверь»). В этом случае фамилия могла быть тотемной или указывать на качества предка: смелость, свирепость, одиночество.

География фамилии подтверждает её южное происхождение. Основная масса носителей фамилии Жерегя встречается в Краснодарском крае, Адыгее и Ставрополье — регионах с сильным тюркским и кавказским влиянием. Встречаются единичные случаи в Крыму и на юге Украины. Фамилия не имеет дворянской родословной и не фиксируется в дореволюционных родословных книгах — это указывает на позднее оформление (конец XIX — начало XX века) и крестьянское или казачье происхождение.

Словообразовательный разбор показывает, что фамилия не получила русских суффиксов (как Жерегин или Жерегов), что говорит о её относительно недавнем закреплении в документах уже в нынешней форме. Носители фамилии, как правило, не знают точного значения, но интуитивно связывают её с землёй или местностью. Спектр версий узок, и самая правдоподобная — именно «земельная»: предок был человеком, прочно связанным с участком земли, возможно, первым поселенцем или старожилом.