Фамилия Жиздюкова — женская форма, мужская — Жиздюков. Её основа — прозвище Жиздюк, которое, скорее всего, связано с гидронимом — названием реки Жиздра. Эта река протекает в Калужской области, а на её берегах стоит город с тем же именем. В русской ономастике есть целый пласт фамилий, образованных от названий рек: Волгин, Донской, Уфимцев, Иртышов. Жиздюков мог возникнуть как «выходец с Жиздры» или «живущий на Жиздре». Суффикс -юк здесь характерен для западнорусских и украинских говоров, он часто указывал на принадлежность к месту или роду. В белорусской и украинской традиции фамилии на -юк распространены повсеместно, а в русском ареале они встречаются в пограничных с Беларусью областях — Брянской, Смоленской, а также в Калужской.

Вторая версия, менее вероятная, связывает прозвище с диалектным словом «жиздра» — так в некоторых говорах называли гравий, крупный песок или даже жидкую грязь. В этом случае прозвище Жиздюк могли дать человеку, который работал на добыче песка или жил в болотистой, топкой местности. Однако приоритет речной версии подтверждается тем, что фамилии, образованные от гидронимов, в русской среде гораздо массовее, чем прозвища от нарицательных слов с неочевидной семантикой.

Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий она не фигурирует. Её носители, скорее всего, происходят из юго-западных областей России, из зоны расселения вятичей, где и протекает Жиздра. Суффикс -ов в мужской форме указывает на стандартную русскую патронимическую модель, но сама основа — неканоническое прозвище, а не крестильное имя. Это значит, что предок Жиздюковых был не просто «чей-то сын», а получил фамилию по месту своего прежнего жительства, что типично для крестьян, переселявшихся в другие деревни или уезды в XVII–XIX веках.