Фамилия Жоббаров — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не славянское, а тюркское. Основа фамилии — личное имя Жоббар, которое восходит к арабскому «Джаббар» (جَبَّار), что означает «могущественный», «всесильный», «грозный». В исламской традиции это один из эпитетов Аллаха (аль-Джаббар — «Обладающий могуществом»), но имя могло даваться и людям как пожелание силы или как оберег.

Русский суффикс -ов, присоединённый к основе, указывает на то, что фамилия оформлялась уже на русской почве: по модели «чей?» — «сын Жоббара». Такая адаптация характерна для народов Поволжья, Средней Азии и Кавказа, где при интеграции в российскую административную систему тюркские и мусульманские имена получали типичные русские патронимические окончания. Встречается и вариант написания через «а» — Жаббаров, но написание с «о» (Жоббаров) может отражать особенности местного произношения (например, в некоторых тюркских языках «а» в первом слоге звучит ближе к «о»).

Географически фамилия тяготеет к Узбекистану, Таджикистану и южным регионам России, где сильны тюркские и иранские корни. В дореволюционной России носители такой фамилии, скорее всего, были выходцами из крестьян или ремесленников, получивших фамилию при переписях или приписке к сословию. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано.

Словообразовательная модель проста: имя Жоббар + суффикс -ов. Это типичный пример того, как восточное имя, пройдя через русскую канцелярию, закрепилось в виде фамилии, сохранив память о своём сакральном значении.