Фамилия Жубатканова — один из тех родовых имен, где за звучанием стоит развернутое имя-пожелание. В основе лежит личное имя Жубаткан, которое на тюркском Востоке могли дать по двум причинам: по дню недели и по числу.

Имя Жубаткан составное. Первая часть, «жубат», восходит к древнетюркскому слову со значением «пара, четное число». Имя с таким корнем нередко получал ребенок, родившийся в четный день месяца. Но у того же «жубат» есть и второе значение — «утешать, ласкать». Вторая часть, «кан», в древнетюркском означает «среда» — день недели. Получается, что имя Жубаткан могли трактовать двояко: либо как «родившийся в среду четного числа», либо как «утешитель, появившийся на свет в среду». Оба варианта укладываются в традицию давать детям имена по обстоятельствам рождения.

Фамилия образована по русской модели: к основе Жубаткан добавили суффикс -ов (в женском роде — -ова), который указывает на принадлежность: «потомок Жубаткана». Это типичный для славянской ономастики способ, который в XIX–XX веках активно применяли и к тюркским именам при оформлении фамилий в документах. А вот тюркский суффикс -оглы/-оглу (буквально «сын, потомок») в этой фамилии не использован — его можно встретить в турецких, гагаузских и некоторых других тюркских фамилиях, но здесь мы видим адаптацию через русское окончание.

Так что носительница фамилии Жубатканова может связать свою родословную с человеком, чье имя было привязано к календарю и числу — обычная для кочевых тюркских народов практика, когда имя служило напоминанием о дне появления на свет.