Фамилия Жубатова хранит в себе сразу несколько возможных значений, и разобраться в них помогает обращение к тюркским языкам, в первую очередь к киргизскому. Основа фамилии — прозвище Жубат. Оно могло появиться разными путями.

Самая прямая версия отсылает к киргизскому слову «жубат» в значении «пара, четное число». Так могли назвать ребенка, который родился в семье вторым, четвертым или шестым по счету — то есть «четным». В культурах, где числовая символика имела значение, подобные прозвища были естественным способом закрепить за человеком его порядковое место среди братьев и сестер.

Другая версия связана с глагольным значением того же корня — «утешать, ласкать». В этом случае прозвище Жубат указывало бы на характер: добрый, сочувствующий человек, умеющий успокоить и поддержать. Такие прозвища по душевным качествам давались не реже, чем по внешности или профессии.

Есть и третий вариант, более редкий. В старину «жубатом» называли сорт материи. Если предок Жубатовых имел дело с тканями — торговал ими или шил одежду, — прозвище могло закрепиться за ним по роду занятий. Тогда фамилия относится к «профессиональным» именованиям, а родоначальник, возможно, был портным или торговцем сукном.

Суффикс «-ова» — классический для русских фамилий, образованных от мужских прозвищ. Он указывает на принадлежность: «Жубатова» буквально значит «дочь (или жена) Жубата». То есть фамилия закрепилась за женщиной, но ее основа — мужское прозвище Жубат.

Какая из версий верна для конкретной семьи, без генеалогического исследования сказать нельзя. Фамилия могла возникнуть в разное время и в разной среде, и только архивные записи — метрики, ревизские сказки — способны расставить точки над i.