Фамилия Жубатова образована от прозвища Жубат, в основе которого лежит киргизское слово «жубат», то есть «пара, четное число». Вполне возможно, что родители могли дать такое прозвище своему ребенку, родившемуся в семье по счету четным. По другой версии, прозвище Жубата восходит к такому значению слова «жубат», как «утешать, ласкать». Поэтому не исключено, что данное прозвище указывает на черты характера предка Жубатовых – доброта, сочувствие. Кроме того, в старину жубатом называли сорт материи. Возможно, что данное прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник Жубатовых был портным. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Жубатовых можно лишь на основании генеалогических исследований.