Фамилия Жуковкин образована от прозвища или нецерковного имени Жуковка, а то, в свою очередь, — от слова «жук». В русской ономастике это типичная модель: к основе на -к- (Жук → Жуков → Жуковка) добавили суффикс принадлежности -ин. То есть Жуковкин буквально означает «сын (или потомок) Жуковки».

Обычно прозвище Жук давали человеку с тёмными волосами или смуглой кожей, реже — хитроватому, «жучковатому» по характеру. Форма Жуковка — это либо уменьшительно-ласкательное от того же прозвища (маленький Жук), либо, что встречается реже, от названия населённого пункта вроде деревни Жуковка. Таких деревень много в центральной России, особенно в бывших Рязанской и Тульской губерниях, так что географический след здесь возможен.

Важный нюанс: фамилия заканчивается на -кин, а не на -ков. Суффикс -ин указывает на притяжательность от основы, оканчивающейся на согласный (в данном случае на -а: Жуковк-а → Жуковк-ин). Если бы предка звали просто Жук, фамилия была бы Жуков. А Жуковкин — это уже «внук» по отношению к исходному прозвищу, то есть фамилия прошла через дополнительную ступень образования. Это делает её менее частой, чем Жуков, но вполне органичной для русской фамильной системы.

В сословном плане носители фамилии были, скорее всего, крестьянами или мещанами. Фамилии на -ин в этой среде обычны: они фиксировали принадлежность к конкретному двору или семейству, часто по прозвищу старшего в роду. Среди дворян Жуковкины не встречаются — нет ни одного упоминания в родословных книгах. Встречаемость фамилии невысокая, но стабильная: по данным переписей XIX века, основное гнездо — юг Московской губернии и север Рязанской.