Фамилия Жундыбаева — редкий пример, где географический ключ важнее попыток разобрать корень по частям. Она почти наверняка казахская или тюркская по происхождению, что видно по её строению. Основа здесь — мужское имя или прозвище Жундыбай, к которому добавлен русский патронимический суффикс -ев (в женском роде — -а). Такая модель типична для русифицированных фамилий народов Средней Азии и Казахстана: к тюркскому имени пришивают русское окончание, чтобы вписать человека в имперскую или советскую бюрократию.

Само имя Жундыбай разбирается сложнее. Первая часть, «жунды», может восходить к казахскому слову «жүн» — шерсть, руно. Тогда Жундыбай — это «богатый шерстью», «владелец отары», что указывает на занятие предка скотоводством. Но есть и другая версия: в некоторых тюркских диалектах «жун» или «джун» означало «война», «битва». В этом случае имя давали мальчику, родившемуся в смутное время, или как оберег — чтобы рос воином. Вторая часть, «бай», общеизвестна: хозяин, богач, уважаемый человек. Имя-композит с «бай» было одним из самых распространённых способов именования в казахской среде.

Необычность фамилии ещё и в том, что она сохранила «ж» в начале. В русской передаче тюркских имён «ж» часто заменяли на «дж» или «з», но здесь этого не произошло, что говорит о поздней фиксации — скорее всего, в советских документах 1920–1930-х годов, когда записывали уже по живому произношению. Если бы фамилия оформлялась раньше, в XIX веке, она могла бы выглядеть как Дзундыбаев или Зюндыбаев.

Носительницы фамилии Жундыбаева, скорее всего, происходят из казахских родов, кочевавших в степях современного Казахстана или прилегающих областей России (Астраханская, Оренбургская губернии). Прямых указаний на сословную принадлежность нет, но «бай» в основе намекает, что предок был не рядовым скотоводом, а человеком с достатком и весом в ауле. Встретить эту фамилию за пределами Казахстана и сопредельных регионов можно, но редко — она не пошла вширь, осталась локальной.