Фамилия Жунискалиев — редкий пример фамилии, образованной от сложного арабско-тюркского имени, которое пришло в русский язык через казахскую ономастику. Её основа — составное мужское имя Жунискали (или Жүнісқали), где первая часть «Жунис» (Жүніс) восходит к арабскому Юнус (библейский пророк Иона), а вторая — «кали» (қали) означает «дорогой», «ценный» или происходит от арабского «халид» — «вечный». Таким образом, имя можно перевести как «драгоценный, как Юнус» или «вечный Юнус». Фамилия образована по типичной для тюркских народов модели: к имени добавили русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Поэтому Жунискалиев буквально означает «потомок (сын) Жунискали».

Географически фамилия почти целиком привязана к Западному Казахстану, в частности к Атырауской и Мангистауской областям. Это не случайно: имя Юнус (Жунис) особенно распространено в мусульманских общинах региона, а компонент «кали» характерен для казахских составных имён (ср. Аликали, Биржанкали). В отличие от многих русских фамилий, здесь нет сословной подоплёки — предки носителя скорее всего были скотоводами или рыбаками, жившими в низовьях Урала или на побережье Каспия.

Интересная деталь: в русских документах фамилию часто записывали с буквой «и» после «ж» (Жунискалиев), хотя в казахском оригинале звук ближе к «ү» (Жүнісқалиев). Это типичный случай адаптации тюркских имён к кириллической орфографии, когда «ү» заменяли на «у» или «ю». Встречаются и варианты Жунускалиев, но они редки. Фамилия не имеет отношения к русскому слову «жулик» или чему-то подобному — это чисто ономастическое совпадение звучания.

С точки зрения словообразования, фамилия демонстрирует, как в XIX–XX веках казахские родовые имена превращались в фамилии через добавление русского суффикса. Если бы не русификация, носитель мог бы зваться просто Жунискали, без окончания. Но в паспортной системе СССР закрепился именно вариант с -ев, что и дало современную форму.