Фамилия Жунисалиева — яркий пример того, как русский суффикс «прирастает» к восточному имени, создавая фамилию, понятную по модели образования, но экзотичную по корню. Её основа — мужское имя Жунисали или Жунисалы, которое почти наверняка имеет тюркское происхождение, скорее всего, казахское или киргизское. В этих языках имя могло сложиться из двух частей: «жүніс» (вариант имени Юнус, библейского Ионы) и «әли» (от арабского «Али» — высокий, возвышенный). Получается составное имя вроде «Юнус-Али», что типично для мусульманской ономастики Средней Азии, где два имени соединяли в одно для благословения или отличия рода.

Суффикс «-ева» указывает на принадлежность: Жунисалиева — это «дочь (или жена) Жунисали». Для мужского варианта фамилия звучала бы как Жунисалиев. Такая модель — основа на согласный + -ев — абсолютно стандартна для русских фамилий, образованных от иноязычных имён. В XIX–XX веках, при интеграции народов Средней Азии в состав Российской империи, многие местные имена русифицировали, добавляя к ним фамильные суффиксы. Так Жунисали и стал родоначальником целой семьи Жунисалиевых.

Географически фамилия тяготеет к югу Казахстана и северу Киргизии, где распространены имена с корнем «жүніс». Встречается она в основном у казахов и киргизов, реже у других тюркских народов. За пределами Средней Азии фамилия редка, что делает её хорошим маркером происхождения из этого региона. Сословно предки носителя фамилии, скорее всего, были простыми скотоводами или земледельцами, так как аристократические тюркские фамилии чаще образовывались от титулов (батыр, бий), а не от личных имён.

Что касается написания: двойное «с» в середине (Жунисалиева) — не ошибка, а следствие того, что в тюркском произношении звук «с» в имени Жунисали мог быть долгим или удваиваться при склонении. В русской транскрипции это закрепилось как «сс», хотя встречаются варианты и с одной «с» — Жунисалиева. Оба варианта имеют право на существование, но форма с двумя «с» встречается чаще в официальных документах.