Фамилия Жунусалиева — характерный пример фамилии, образованной от сложного тюркского имени. Она распространена у народов Центральной Азии, прежде всего у казахов и киргизов, и напрямую указывает на родовую принадлежность: суффикс -ев/-ева в русской записи закрепил форму «чей?» — потомок человека по имени Жунусали.

Основа фамилии — двухкомпонентное личное имя Жунусали. Первая часть, «Жунус», — это тюркская переработка арабского имени Юнус (библейский пророк Иона, в исламской традиции — пророк Юнус). Вторая часть, «Али», — одно из ключевых имён в исламе, восходящее к халифу Али, двоюродному брату и зятю пророка Мухаммеда. Сложение двух имён в одно — распространённый восточный приём, который усиливал благословение: ребёнка называли двойным именем, соединяя достоинства двух почитаемых фигур. Таким образом, Жунусали — это «Юнус и Али», или «тот, кто носит имена Юнуса и Али».

Словообразовательная модель здесь не русская, а адаптированная. В тюркских языках фамилий в привычном нам смысле не было до XX века. Носитель имени Жунусали становился «Жунусали уулу» (сын Жунусали) или «Жунусали кызы» (дочь Жунусали). При советской паспортизации в 1920–1930-х годах эти патронимы переоформили по русскому образцу: к основе имени добавили суффикс -ев/-ева, что и дало вариант Жунусалиев/Жунусалиева.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам Казахстана и северу Киргизии — областям, где исторически сильны исламские традиции и распространены сложные арабо-тюркские имена. Встречаются варианты написания: через «о» (Жунусалиева) или с удвоением «с» (Жунуссалиева), но исходная форма с одним «с» и «у» в первом слоге — основная.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную модель именования: двойное имя, где оба компонента — пророческие имена, редко встречающиеся вместе в русском ономастиконе. Это не фамилия от профессии или прозвища, а чисто родовая, по имени предка-мужчины, который, судя по всему, был человеком верующим и следовал традиции давать детям имена, соединяющие благодать двух пророков.