Фамилия Жунус — один из тех случаев, когда ответ лежит на поверхности, но не для носителя русского языка. Всё дело в исходном имени: Жунус — это тюркская и арабо-мусульманская форма библейского имени Иона (пророк, которого проглотил кит). В исламской традиции этого пророка зовут Юнус, и в казахском, киргизском, узбекском языках имя звучит как Жунус (через «ж» вместо «й»). Фамилия, таким образом, образована напрямую от личного имени без каких-либо русских суффиксов — это так называемая «чистая» фамилия, когда имя отца становится фамилией сына без добавления -ов или -ев.

Такая модель образования — прямое заимствование имени в роли фамилии — характерна для тюркских народов, особенно для казахов и киргизов. В русской паспортной системе такие фамилии не склоняются, хотя в родных языках у них есть падежные формы. Если бы фамилия оформлялась по русскому образцу, мы бы получили варианты вроде Жунусов или Жунусин, но носители сохранили исходный вид.

География фамилии почти целиком привязана к Центральной Азии: Казахстан, Кыргызстан, отчасти Узбекистан и Каракалпакстан. В России она встречается редко и почти всегда у выходцев из этих регионов. Спорных версий здесь немного: некоторые этимологи-любители пытаются связать Жунус с тюркским словом «жун» (шерсть) или «жунды» (мохнатый), но это натяжка — фонетически и семантически связь с именем Юнус/Иона гораздо прямее и подтверждается массовыми записями в метрических книгах XIX века, где имя Жунус фиксировалось как личное.

Что касается социального контекста: носители имени Жунус в XIX — начале XX века были преимущественно скотоводами и земледельцами, реже — торговцами на базарах. Фамилия не указывает на аристократическое происхождение или принадлежность к «белой кости» (торе), а скорее на рядовую кочевую или оседлую семью, которая просто назвалась по имени деда или отца. В советское время, при выдаче паспортов, многие казахи и киргизы записывали фамилию именно как отчество без изменений, поэтому Жунус остался в документах в чистом виде.