Фамилия Жунусалиев — яркий пример того, как в одной словоформе сплелись две разные культурные и языковые традиции. Её основа — двусоставное мусульманское имя Жунусали, где первая часть восходит к арабскому имени Юнус (библейский Иона, пророк в исламе), а вторая — к имени Али (зять пророка Мухаммеда). Сращение двух имён в одно — распространённый на Востоке способ почтить сразу нескольких почитаемых персонажей или подчеркнуть родственные связи. Русский суффикс -ев, присоединённый к такой основе, указывает на патронимический характер фамилии: Жунусалиев буквально означает «потомок Жунусали».

Географически фамилия бытует почти исключительно среди тюркских народов Центральной Азии, особенно в Казахстане и Кыргызстане. В русской ономастике она появилась относительно поздно, в XIX–XX веках, когда при Российской империи, а затем в советское время у местного населения начали массово фиксировать фамилии по русской модели. Интересно, что в казахской среде встречается вариант написания Жүнісәлиев (с буквой «ү» и мягким знаком), что точнее передаёт произношение, но в русскоязычных документах закрепилась форма «Жунусалиев».

Словообразовательный разбор показывает необычную для славянских фамилий структуру: основа состоит из двух полных имён, соединённых без соединительной гласной. Это отличает её от, скажем, «Абдуллаевых» или «Ибрагимовых», где первая часть — часто титул или прозвище. Здесь же мы видим редкий случай удвоения семантически значимых элементов: и Юнус, и Али — ключевые фигуры в исламской истории, поэтому имя-композит могло даваться ребёнку в знак особого почитания или как оберег.

Сословная принадлежность предков по фамилии не определяется — Жунусалиевы могли быть и скотоводами, и ремесленниками, и представителями духовенства. Скорее всего, первоначально это было родовое прозвание, которое закрепилось за потомками конкретного человека по имени Жунусали. Со временем, в ходе унификации фамилий в советский период, оно перешло в разряд наследственных, потеряв связь с личным именем конкретного предка.