Фамилия Зикиряев — редкий пример, где основа почти наверняка восходит к арабскому имени Зикри (Зикрулла, Зикрай). В исламской традиции «зикр» означает поминание Всевышнего, поэтому имя Зикрулла переводится как «поминающий Аллаха». В тюркской среде, особенно у татар и башкир, это имя давали с религиозным смыслом, и со временем оно превратилось в фамилию через стандартный русский суффикс -ев (вариант -ов после мягкой основы). Так Зикиря — это разговорная форма имени Зикрулла (с усечением и тюркским окончанием -й), а Зикиряев — «сын Зикири».

Главная особенность — суффикс -ев, а не -ов. В русской фамильной модели суффикс -ев присоединяют к основам на мягкий согласный, -й или -ь. Если бы в основе было имя Зикрулла, фамилия звучала бы как Зикруллин или Зикруллов. А вот Зикиряев чётко указывает на краткую форму — Зикиря. Такие усечённые имена (Ахмад → Ахматя, Зикри → Зикиря) типичны для татарского и башкирского быта: так называли детей в семье, а при оформлении документов в XIX веке эта форма и закрепилась.

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону, в первую очередь к Татарстану и Башкортостану. Встречается она и среди казахских родов, но там она обычно записывается как Зикирияев или Зикирия. Русское окончание -ев в казахской среде — признак более поздней русификации при переписях. Сословный состав носителей — почти исключительно крестьяне и мещане, дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Спорных версий происхождения практически нет. Иногда фамилию пытаются вывести от тюркского «зикер» (в значении «быстрый, проворный»), но это натяжка: в тюркских языках такого прилагательного нет, а все словари указывают на арабский корень. Поэтому версия с именем Зикрулла — единственная обоснованная. Сравните с однокоренными фамилиями: Зикруллин, Зикриев, Зикряев — все они образованы от того же корня, но разными суффиксами. Зикиряев среди них — самый редкий по модели образования.