Фамилия Зинухов — редкий случай, когда основа ясна, а путь образования вызывает вопросы. В её основе лежит нецерковное имя или прозвище Зинуха. Это, в свою очередь, уменьшительная форма от одного из крестильных имён: Зиновий (греч. «живущий богоугодно») или Зосим (греч. «подпоясанный», «сильный»). В народной речи оба имени часто сокращали до коротких и ласковых форм: Зина, Зиня, Зинуха. Так что первый предок Зинуховых, скорее всего, был Зиновием или Зосимом, которого в быту звали Зинухой.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Зинухов буквально значит «сын Зинухи» или «из семьи Зинухи». Фамилия образована от прозвищной формы, а не от полного канонического имени, что характерно для крестьянской и мещанской среды XVII–XIX веков. В официальных документах такие фамилии закреплялись, когда человека записывали по отцу: «Иван Зинухов сын» — то есть сын того, кого звали Зинухой.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям. Встречается в Воронежской, Ростовской, Волгоградской областях, а также на Кубани. Это подтверждает связь с диалектной средой, где имя Зиновий было распространено, а форма Зинуха бытовала как вполне обычное обиходное имя.

Версия о происхождении от слова «зинуть» (раскрыть рот, зевать) или «зинуха» (ротозей) маловероятна. Такое прозвище закрепилось бы с уничижительным оттенком, но в основе фамилии лежит именно личное имя — об этом говорит сам суффикс -ух(а), характерный для уменьшительных форм имён (Петруха, Митюха, Ванюха). Сравните с фамилиями Зиновьев и Зосимов: Зинухов стоит в том же ряду, но образован от более народного, разговорного варианта.