Фамилия Зиягинцев — редкий пример, где основа, скорее всего, тюркская, а суффикс — русский, причём не самый распространённый. Если бы фамилия оканчивалась на -ов (Зиягинцев), она звучала бы привычнее, но здесь мы видим суффикс -инцев. В русской ономастике суффикс -инцев обычно указывает на принадлежность к группе людей, объединённых общим признаком, часто — по имени или прозвищу родоначальника. То есть Зиягинцев — это «сын человека по прозвищу Зияга» или «потомок того, кого звали Зиягой».

Самая вероятная версия происхождения основы — от тюркского имени Зия или Зияуддин. Имя Зия (арабского происхождения, означает «свет», «сияние») было распространено у народов, исповедующих ислам, в том числе у татар, башкир, казахов. В русской среде это имя могло обрасти уменьшительно-ласкательной формой — Зияга (как, скажем, от Иван — Ивага). Такая модель характерна для фамилий, образованных от прозвищ, которые давали в смешанной этнической среде, особенно в Поволжье или на юге России, где татары и русские жили бок о бок.

Менее правдоподобная, но возможная версия — связь с диалектным словом. В некоторых южнорусских говорах «зияга» могло означать что-то вроде «ротозей» или «разиня». Однако в этом случае фамилия скорее писалась бы через «е» (Зеягинцев) или «я» под ударением, а корень был бы чисто русским. Учитывая редкость фамилии и её фонетику, тюркская версия выглядит убедительнее.

Географически фамилия Зиягинцев встречается единично, в основном в центральных и южных регионах России, что подтверждает её позднее оформление и локальный характер. Сословного барьера не было: такую фамилию мог получить и крестьянин, и мещанин, если в его роду был человек с необычным прозвищем. Известных носителей, оставивших заметный след в истории, нет — фамилия осталась в тени, что типично для поздних и редких образований.

Таким образом, Зиягинцев — это фамилия, которая несёт в себе след этнического контакта: русская грамматическая форма на -инцев скрывает тюркское имя, обозначающее «свет». Предок носителя, скорее всего, был человеком, которого в русскоязычной среде называли уменьшительным именем Зияга.