Фамилия Зизюлин — один из тех случаев, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка звучало насмешливо. Корень здесь — диалектное слово «зизя», «зизюля». В разных русских говорах так называли неряху, неопрятного человека, а иногда — плаксу или капризного ребёнка. В словаре Владимира Даля «зизя» — это «грязнуля, чумичка». Прозвище давали тому, кто ходил неопрятным, или же, в переносном смысле, человеку с неприятным, «плаксивым» характером.

Суффикс «-ин» указывает на модель образования от слов первого склонения (на -а, -я). «Зизюля» → «Зизюлин» — буквально «сын Зизюли» или «человек из семьи Зизюли». Такая модель типична для центральных и северных регионов России. Фамилия не относится к числу очень распространённых, что говорит о локальном бытовании прозвища — скорее всего, в какой-то одной местности, где слово «зизя» было в ходу.

Интересно, что в южнорусских и украинских говорах слово «зизюля» может означать «кукушка» (от общеславянского «zъzulja»). Но для фамилии Зизюлин эта версия менее вероятна: прозвище по птице обычно давали за внешнее сходство или повадки, а «кукушка» в этом значении дала бы фамилию Зизюлин или Зозулин — ударение и написание были бы иными. Скорее всего, мы имеем дело именно с северным или среднерусским прозвищем для нечистоплотного человека.

В документах фамилия встречается с XVIII века, преимущественно среди крестьян и однодворцев Тульской, Рязанской и Тамбовской губерний. В этих краях слово «зизя» было хорошо известно. Никакой благородной или «птичьей» подоплёки тут нет — перед нами бытовое, меткое прозвище, каких тысячи легли в основу русских фамилий. Носитель фамилии Зизюлин может считать, что его предка когда-то прозвали за неопрятность или плаксивость, но со временем эта характеристика стёрлась, оставив лишь фамильное имя.