Фамилия Злодырев образована по стандартной модели с суффиксом -ев, который присоединяли к основам на мягкий согласный. В её центре — прозвище Злодырь, а вот его значение не так однозначно, как может показаться на первый взгляд.

Самая распространённая версия связана с древнерусским словом «злоба» — зло, беда, несчастье. Прямое прозвище «злой человек» давали редко: в народной культуре такие имена часто выполняли охранительную функцию. Считалось, что если назвать ребёнка Злодырем, злые силы потеряют к нему интерес — он уже «плохой», портить дальше нечего. Это та же логика, по которой появлялись имена Некрас, Нелюб, Дурак.

Но есть и вторая, более бытовая версия. В говорах «злодырь» могли называть вора, мошенника или человека, способного на злодеяние. В этом случае прозвище было не оберегом, а характеристикой — либо взрослого человека за его поступки, либо насмешливым прозвищем за хитрость или нечистоплотность в делах.

Какая из версий верна для конкретной семьи, сегодня не установить. Но в обоих случаях фамилия Злодырев — это отчество от прозвища: «чей?» — Злодырев, то есть сын Злодыря. По сословному составу фамилия скорее крестьянская или мещанская: в дворянскую среду такие «отрицательные» прозвища проникали редко. Географически фамилия встречается в центральных и южных областях России, но не относится к числу широко распространённых.