Фамилия Зобенкин образована по редкой и оттого особенно интересной модели. В ней сочетается суффикс -енк-, типичный для украинских и южнорусских фамилий (уменьшительно-уничижительный оттенок), и русский патронимический суффикс -ин. Фактически, перед нами двойная фамилия: сначала от прозвища Зобенка (что значит «маленький Зоб» или «Зоб с уменьшительным суффиксом») образовали отчество Зобенкин — «сын Зобенки». Такая конструкция встречается нечасто и указывает на то, что основа фамилии восходит к прозвищу, а не к крестильному имени.

Само прозвище Зобенка, а затем и Зобенкин, скорее всего, связано со словом «зоб». В старину зобом называли не только болезненное увеличение щитовидной железы, но и мешок, сумку, котомку (в некоторых говорах). По одной из версий, прозвище дали человеку с заметным зобом — по внешнему признаку. По другой, более правдоподобной, Зобенкой могли прозвать того, кто носил с собой мешок или котомку — например, странника, нищего или торговца, ходившего с товаром за плечами. В словаре В. И. Даля «зобенька» — это плетеная корзинка или лукошко, а «зобеня» — сумка. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть коробейником, бродячим ремесленником или просто человеком, которого в округе знали по его неизменной котомке.

Фамилия Зобенкин — редкая, встречается в основном в центральных и южных областях России, а также среди потомков переселенцев на Урал и в Сибирь. В дореволюционных документах встречаются варианты написания Зобенькин и Зобинкин, что подтверждает народное произношение с безударным «е». В отличие от распространенных фамилий на -ов и -ин, Зобенкин не связана ни с одним церковным именем, а целиком уходит корнями в мир бытовых прозвищ, что делает её ценной для изучения народного языка и быта.