Фамилия Зубяирова образована от мужского варианта Зубяиров, который, в свою очередь, восходит к прозвищу или нецерковному имени Зубяир. Это имя — явный тюркизм, и его происхождение стоит искать в арабском или тюркском мире, адаптированном через мусульманскую ономастику. Скорее всего, в основе лежит арабское имя Зубайр (уменьшительная форма от «зубр» — сильный, могучий), которое через тюркские языки (татарский, башкирский, казахский) получило огласовку «Зубяир». Фамилия типична для народов Поволжья и Урала, особенно для татар и башкир, где широко распространены фамилии на -ов/-ев, образованные от мусульманских имен.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Зубяиров — буквально «сын Зубяира» или «из рода Зубяира». Женская форма Зубяирова появилась как естественное грамматическое изменение при фиксации фамилий в паспортной системе XIX–XX веков. В отличие от русских фамилий, где суффикс -ин часто указывает на принадлежность матери, здесь он не используется, и форма остаётся стандартной патронимической.

Географически фамилия редкая и локальная. Основной ареал — Татарстан, Башкортостан и прилегающие области. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках её можно встретить среди тептярей и государственных крестьян нерусского происхождения. Встречаются варианты написания: Зубяиров, Зубаиров, Зубайров — это следствие разной передачи арабской буквы «за» и редукции гласных в живой речи. Наиболее точная форма — Зубяиров, так как она сохраняет ударение на второй слог и ясную этимологию.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же татарских фамилий, как Зубаиров, Зубайдуллин, Зубаиров. Интересно, что в русских говорах слово «зубяировать» не зафиксировано, поэтому все попытки связать фамилию с глаголом «зубрить» или существительным «зуб» — народная этимология, не выдерживающая критики: суффикс -яир не характерен для русских прозвищ. Единственная правдоподобная версия — через арабское имя, что подтверждается и структурой фамилии, и регионом её бытования.