Фамилия Зуданов образована по стандартной для русских фамилий модели: с помощью суффикса -ов от прозвища или имени Зудан. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Зуданов — буквально «сын Зудана» или «человек из рода Зудановых». Основа здесь — слово «зуд», которое в старину имело не только медицинский смысл, но и переносный: «неотвязный, надоедливый человек», «придира», «тот, кто донимает просьбами или бранью». В словаре В. И. Даля «зуд» зафиксирован и как «чесотка», и как «неугомонный, докучливый человек». Таким образом, прозвище Зудан могли дать человеку беспокойному, въедливому, склонному к спорам или жалобам.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «зуда» в значении «плакса» или «нытик». В некоторых говорах так называли капризного ребёнка. Если это так, то прозвище могло быть внутрисемейным и не обязательно нести резко отрицательный оттенок — в крестьянской среде такие прозвища часто давали по заметной черте характера, не вкладывая в них злого смысла.

Географически фамилия редкая и не встречается массово ни в одном регионе. По данным открытых источников, единичные носители Зудановых фиксируются в центральных областях России (Тверская, Ярославская, Московская), а также на Урале. Это указывает на то, что фамилия не принадлежала к числу дворянских или купеческих родов, а скорее всего, возникла в крестьянской или мещанской среде. Суффикс -ов типичен для великорусских фамилий, сформировавшихся в XV–XVII веках, когда прозвища переходили в фамилии через поколение.

В ономастике фамилия Зуданов стоит в одном ряду с такими же «зудящими» фамилиями, как Зудин, Зудов, Зудков. Все они образованы от одной корневой основы, но разными суффиксами. Зуданов — самая полная форма, с суффиксом -ан, который в русских прозвищах часто придавал оттенок ласкательности или, наоборот, ироничности (ср. Болван, Гулян, Смеян). То есть Зудан — это не просто «зуд», а «зудень» или «тот, кто постоянно зудит».

Сегодня фамилия не вызывает никаких отрицательных ассоциаций — она просто фиксирует прозвище далёкого предка. Носители фамилии могут считать, что их предок был человеком с живым, беспокойным характером, который не давал окружающим скучать.