Фамилия Абаганов — один из самобытных памятников хакасской культуры, и её происхождение напрямую связано с тем, как в XVIII–XIX веках у хакасов формировались родовые имена. Дело в том, что до введения ясачного сбора (подати пушниной) у хакасов не было фамилий в привычном нам понимании. Само понятие «фамилия» передавалось словом «обеке» («предок») или описательно — «пiчiкке кiрчен», то есть «закрепленный в документе». Фамилии давали по имени главы самостоятельного хозяйства, поэтому однофамильцев среди хакасов было крайне мало.

В основе фамилии Абаганов лежит именование Абаган, и здесь возможны две основные трактовки. Первая, наиболее прямая, восходит к хакасским словам «аба» (медведь) и «хан» или «кан» (кровь). В этом случае Абаган означает «медвежья кровь» — такое имя могли дать ребёнку как оберег или в честь тотемного зверя. Вторая версия связывает фамилию с названием города Абакан (по-хакасски — Агбан, Абаган или Абыган), которое, в свою очередь, перешло от реки. Тогда Абаганов — это потомок выходца с берегов Абакана.

Интересно, что сам топоним Абакан оброс легендами, которые напрямую перекликаются с этимологией фамилии. В одной из них фигурирует богатырь Аба-кан («медвежья кровь» или «медведь-хан»), который на коне перепрыгивал реку, но однажды оступился во время разлива, и реку назвали в его честь. В другой легенде рассказывается о медведе-великане, терроризировавшем аул, которого победил молодой алып (богатырь). Поверженный медведь превратился в гору, из которой забил источник, давший начало реке.

Фамилия оформлена по русской модели с суффиксом -ов, что типично для фамилий, возникших у хакасов в период активного взаимодействия с русской административной системой. Так что Абаганов — это не просто фамилия, а связующее звено между языком, географией и древними степными преданиями.