Фамилия Абайхановы образована от личного мужского имени Абайхан. Это имя составное, тюркского происхождения, и его разбор даёт ключ к пониманию того, чего желали ребёнку родители. Первая часть — «абай» — в казахском и киргизском языках имеет два значения: прямое («старший брат», «дядя», «старший родственник») и переносное («осторожный», «внимательный»). Вторая часть — «хан» — классический тюркский и монгольский титул, означающий «правитель» или «повелитель».

Соединив эти компоненты, имя Абайхан можно перевести как «внимательный правитель» или «старший среди ханов». Вероятно, называя сына таким именем, родители вкладывали надежду на то, что он вырастет уважаемым, рассудительным человеком, способным занять достойное положение в обществе. Фамилия, записанная как Абайхановы (в мужском роде — Абайханов, в женском — Абайханова), указывает на принадлежность к роду или семье человека по имени Абайхан.

По словообразовательной модели фамилия типична для регионов с сильным влиянием тюркских языков: к основе имени добавляется русский патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — «сын Абайхана»). Встречаются варианты написания через дефис или с буквой «е» в суффиксе (Абайханевы), но форма на -ов более распространена. Фамилия редкая, её носители чаще всего встречаются среди народов Северного Кавказа (чеченцы, ингуши) и в среде казахов, что подтверждает её тюркские корни.