Фамилия Абоянцев — редкий случай, когда географическая основа почти очевидна, но запись успела исказиться. В её центре лежит название города Обоянь в Курской области. Жителя Обояни в старину называли «обоянец» или «обоянин». Однако в фамилии закрепилась форма с начальным «А-» — Абоянец, а от неё уже пошёл стандартный патронимический суффикс «-ев»: Абоянцев, то есть «сын Абоянца».

Почему «Обоянь» превратилась в «Абоянец»? В разговорной речи XVI–XVII веков безударное «о» часто звучало как «а» — это явление называется аканьем. Прозвище записывали на слух, и в документах могли зафиксировать «Абоянец». Фамилия закрепила именно этот произносительный вариант, не исправленный потом под книжное написание.

Сам топоним Обоянь, по распространённой версии, восходит к гидрониму Боянь (прежнее название реки Обоянки). В основе лежит тюркское «баян» — «богатый, обильный». Русская приставка «о-» со значением «вокруг, около» дала форму Обоянь, которую осмысляли как «река, текущая по богатой местности». Город-крепость на этом месте основали в 1639 году для защиты южных рубежей, и его уроженцы разносили прозвище по разным землям.

Фамилия Абоянцев — штучная. Она почти не встречается за пределами Курской и соседних областей, что подтверждает её локальное происхождение. Носители фамилии, скорее всего, потомки служилых людей или посадских, переселившихся из Обояни в другие уезды в XVII–XVIII веках.