Фамилия Адугин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Вероятнее всего, она образована от прозвища или имени, которое в основе своей имеет тюркские корни. В пользу этого говорит характерный для многих фамилий на -ин суффикс, указывающий на принадлежность («чей?» — Адугин, то есть сын или потомок Адуги). Сама же основа «Адуг» может восходить к тюркскому слову «адыг» — так называют себя адыги (черкесы), или к личному имени Адыг, которое давали в некоторых тюркоязычных и кавказских культурах.

Вторая, менее распространённая версия связывает фамилию с арабским именем Адиль (справедливый) через диалектные искажения. Однако для фамилии Адугин эта гипотеза слабая, так как переход «л» в «г» нехарактерен для русской адаптации арабских имён. Гораздо правдоподобнее, что предок носителя фамилии был выходцем с Северного Кавказа или из Поволжья, где тюркские и кавказские имена активно входили в русский быт.

Суффикс -ин указывает на то, что фамилия закрепилась в среде, где на вопрос «чей ты?» отвечали именем отца или прозвищем главы семьи. Сословно Адугины могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми — в южных и восточных губерниях России фамилии с подобной основой нередко встречались среди однодворцев и казаков. Географически фамилия наиболее вероятна для регионов, где исторически были контакты с тюркским или адыгским населением: Ростовская область, Ставрополье, Астраханская губерния.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Аду́гин, хотя в устной речи иногда встречается вариант с ударением на первый. Поскольку фамилия редкая, в дореволюционных метрических книгах она могла писаться с вариантами: Адугин, Одугин, Адукин — из-за нечёткости произношения в диалектах. Точных сведений о знаменитых носителях в открытых источниках нет, что только подтверждает её локальный характер и происхождение от конкретного родового прозвища, а не от распространённого имени.