Фамилия Афтении — редкий случай, когда перед нами, скорее всего, не русская, а греческая по происхождению фамилия, адаптированная в русской среде. В привычной модели русских фамилий на -ов/-ев, -ин или -ский её не встретишь. Окончание -ии выдает иноязычный корень, и наиболее вероятная версия ведет к греческому слову αφθενία (afthenia) — «обилие», «достаток», «богатство». В греческом языке это слово имеет и оттенок «власть», «господство», что роднит его с более известным «автократия».

Если исходить из этой версии, то Афтении — это фамилия, образованная от личного имени или прозвища Афтениос, которое давали в честь одного из раннехристианских святых. В православных святцах встречается мученик Афтений (или Авфентий), пострадавший за веру в IV веке. Таким образом, фамилия могла возникнуть у потомков человека, носившего это редкое крестильное имя.

В России фамилия Афтении встречается крайне редко и имеет четкую географическую привязку. Она характерна для потомков греков, переселившихся на юг Российской империи в XVIII–XIX веках, в частности, в Крым и Приазовье. Греческие общины Мариуполя, Таганрога, Керчи — вот среда, где такая фамилия могла закрепиться. Со временем, при записи в русские документы, окончание греческой фамилии могло упроститься или остаться без изменений, что и дало нам форму «Афтении», а не, скажем, «Афтениев».

Интересно, что фамилия не получила типичного русского суффикса принадлежности. Это говорит о том, что её носители долгое время сохраняли обособленность или фамилия была записана в документах уже в «готовом» греческом виде. В отличие от фамилий, образованных от названий профессий, здесь нет указания на ремесло предка. Афтении — это фамилия-символ, указывающая либо на достаток в семье основателя, либо на его имя, данное в честь святого. Второй вариант, с опорой на церковный календарь, выглядит более правдоподобным для традиционного общества.