Прозвище Афтенюк образовано от украинского нарицательного «афта» - «покрытие язвами (единичное или множественное) полости рта в виде белых или красных пятнышек». Вероятно, таким прозвищем нарекли человека, который перенес такое заболевание. Существует также гипотеза, по которой в основе фамилии лежит не прозвище, а мирское имя Афтенюк.