Фамилия Агабекяан — редкий случай, когда написание выдает в носителе армянина почти со стопроцентной уверенностью, но при этом сама форма кажется «неправильной» на фоне привычных армянских фамилий. Обычно мы встречаем окончания -ян, -янц, -енц, -уни. Здесь же — два «а» подряд и конечное «ан», что выглядит как опечатка или результат адаптации в неродной среде. На деле это, скорее всего, вариант фамилии Агабекян, записанный в паспорте или метрике с ошибкой либо сознательно искаженный при русификации. В армянском языке суффикс -ян (восходящий к древнему -янц) означает принадлежность — «из рода такого-то». Основа «Агабек» — сложное имя или прозвище: «ага» (господин, начальник, уважаемый человек) плюс «бек» (князь, господин у тюркских народов). Оба слова заимствованы из тюркских языков, что типично для армянских фамилий, возникших в среде, где армяне веками жили рядом с тюркоязычными соседями (турками, азербайджанцами). Получается, что Агабек — это «господин-бек» или «господин из беков», то есть человек знатного происхождения или просто уважаемый, возможно, старшина общины. Фамилия Агабекян, а значит и Агабекяан, указывает на потомка такого Агабека.

Географически фамилия Агабекян (и её варианты) распространена в западных областях исторической Армении, особенно в районе Вана и Эрзурума, а также среди армянской диаспоры. Двойное «а» могло появиться в советских паспортах, когда чиновник по привычке записал фамилию с окончанием -ян, а носитель произносил её с долгим звуком, или же в документах просто удвоили букву по невнимательности. В любом случае, этимологически это та же самая фамилия, что и Агабекян, и её носители — потомки армянского рода, чей предок носил почетное прозвище или титул «ага-бек». Сословно это, скорее всего, не крестьянская фамилия, а указание на принадлежность к привилегированной прослойке — меликам (князьям) или просто зажиточным горожанам, которые могли позволить себе титулование.