Фамилия Агабекяан с первого взгляда кажется опечаткой. Двойное «а» перед конечным «ан» выбивается из привычного ряда армянских фамилий на -ян, -янц или -уни. Однако именно это написание с почти стопроцентной уверенностью выдает в носителе армянина, хоть и в нестандартной записи. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Агабекян, искаженный при русификации или в советских паспортах: чиновник мог механически добавить суффикс -ян к основе, которую носитель произносил с долгим гласным, либо просто удвоил букву по невнимательности.

Этимологически обе формы восходят к одному корню. Основа «Агабек» — сложное имя или прозвище: «ага» (господин, начальник у тюркских народов) плюс «бек» (князь, господин). Оба слова заимствованы из тюркских языков, что типично для армянских фамилий, возникших в среде, где армяне веками соседствовали с турками и азербайджанцами. Получается, что Агабек — это «господин-бек» или «господин из беков», то есть человек знатного происхождения или уважаемый старшина общины. Армянский суффикс -ян (восходящий к древнему -янц) означает принадлежность к роду — «из рода такого-то». Таким образом, фамилия указывает на потомка человека по имени или прозвищу Агабек.

Географически фамилия Агабекян и её варианты распространены в западных областях исторической Армении, особенно в районе Вана и Эрзурума, а также среди армянской диаспоры. Сословно это, скорее всего, не крестьянская фамилия, а указание на принадлежность к привилегированной прослойке — меликам (князьям) или зажиточным горожанам, которые могли позволить себе двойное титулование. В любом случае, носители фамилии Агабекяан — потомки армянского рода, чей предок носил почетное прозвище «ага-бек», а двойное «а» в написании — лишь случайность документооборота, не меняющая ни значения, ни происхождения фамилии.