Фамилия Агамагомедов образована от восточного мужского имени Агамагомед, которое, в свою очередь, является составным и восходит к двум тюркским именам: Ага, что в переводе с арабского на русский язык означает «господин», и Магомед (варианту имени Мухаммед) - «прославляемый». Пророк Мухаммед стал основателем Исламской религии в VII веке. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Агамагомедовых можно лишь на основании генеалогических исследований.